Історична довідка Мікулинці отримали міське право у 1595 році. На той час воно належало родині Сенявських. Пізніше власниками села стали Зборовські (до 1637 року), потім Конєцпольські, а потім знову Сенявські та Любомирські. Найімовірніше, що перший костел у Микулинцях був збудований або одночасно із заснуванням, або невдовзі після надання адміністративній одиниці міських прав, але згадки про існування дерев'яного костелу (присвяченого св. Івану Хрестителю) в джерелах коливаються близько 1615 р. Також найімовірніше, що костел був зруйнований буквально через кілька років під час турецько-татарської навали. Коли власницею Микулинців стала Людвіка Потоцька (з роду Мнішеків), вона вирішила профінансувати будівництво нової церковної споруди в сучасному для того часу стилі. Одні джерела стверджують, що в селі на той час стояла каплиця, інші вказують на перебудований дерев'яний костел, яким мали опікуватися монахи, що проводили там душпастирські служби і продовжували роботу парафії св. Івана Хрестителя незалежно від існування костелу Пресвятої Трійці.

Тому на новому місці було збудовано нову будівлю. Його освятив львівський архієпископ Вацлав Ієронім Сєраковський у 1779 році, і, ймовірно, саме в 1770-х роках були виконані кам'яні скульптури, що прикрашають фасад костелу, а також різьблені меблі з дерева в єдиному стилі.

Монастир був ліквідований у 1785 році. Після цього будівлю використовували як притулок для бідних. До найбільш значущих подій можна віднести сильний шторм, який зруйнував будівлю в 1799 році, а потім пожежу 1859 року, яка пошкодила костел. Після Другої світової війни костел поступово руйнувався. На щастя, деякі предмети інтер'єру (особливо вівтарні скульптури) були придбані Львівською картинною галереєю. У 1989 році костел повернули католикам, а після розпаду СРСР його відреставрували за проектом Зеновія Лагуша.

Архітектура Комплекс розташований посеред відокремленого села, на площі, на невеликому схилі землі. Пресвітерія звернена на північ. З трьох боків будівля оточена рідкісною малоповерховою забудовою, а з одного - просторими полями. Окрім архітектури будівель 20-го століття та низьковольтних ліній електропередач, ідилічна атмосфера села часом може діяти як машина часу. Іншими словами, будівлі не були щільно вписані в тканину сучасності. З архітектурного боку ми маємо справу з бароко. Дослідники вказують на схожість костелу з іншими відомими спорудами. Серед найважливіших - собор Святої Трійці в Дрездені, собор Святого Юра у Львові, церква Сан-Джорджо Модіка поблизу Рагузи на Сицилії та церква Святого Роха в Парижі.

Будівля збудована з ламаного каменю, що особливо помітно в області фундаменту і в нижній частині стін. Поза тим, вона складається з тонкої барокової цегли. Повністю оштукатурена, вона має три нефи і базилікальне планування. Нава чотиринефна. Фасад будівлі ширший за основний корпус. Він розширений, утворюючи просторовий масив. В інтер'єрі виділяється мурований хор, вбудований у південну апсиду. Приміщення біля ґанку мають форму однопрогонової трибуни, обрамленої подвійними пілястрами в тосканському стилі. Крім головного вівтаря, що зберігся у досить усіченому вигляді, у бічних нефах знаходяться вівтарі Господа Ісуса, а з іншого боку - Діви Марії. Загальний стан збереженості будівлі оцінюється як добрий.

До найважливіших елементів, пов'язаних з оздобленням, обстановкою та оточенням костелу, відносяться:

• досить добре збережена кафедра
• Скульптури святих Петра і Павла на аттику фасаду
• Скульптури св. Івана та св. Луки на фасаді
• Скульптури святих Марка та Матвія на фасаді
• Скульптура св. Йоахима
• Скульптура Діви Марії
• Рельєф Святої Трійці
• Скульптури ангелів на головному вівтарі та вівтарі Господа Ісуса
• Залишки надгробків на церковному подвір'ї
• Дзвіниця