Закінчив Першу середню школу ім. Б. Новодворського у Кракові. У 1969 році з відзнакою закінчив архітектурний факультет Краківської політехніки. До 1972 року був науковим співробітником у відділі професора Вітольда Ценкевича, де працював над проектом нового Краківського технологічного університету в районі Чижини та брав участь в архітектурних конкурсах: Сільськогосподарська академія в Любліні, Drasche Grun - житловий масив у Відні. У 1970 році отримав, як співавтор, першу премію в міжнародному конкурсі на Всесвітню виставку WIG-74 у Відні. Під час перебування у Відні працював в офісі "Prof. G. Lippert Arkitekten" над проектом житлового будинку на Рінгштрассе.

У 1972 році разом з дружиною Барбарою Фогель, архітекторкою, поїхав до Фінляндії, де захистив докторську дисертацію на факультеті архітектури в Отаніємі/Гельсінкі. У Гельсінкі він працював в офісі "Kari Virta OY" над проектом нового Університету Оулу та керував проектом для міжнародного конкурсу Університету Калабрії в Козенці, Італія. У 1974 році він працював в офісі Ola Kivinen OY і отримав разом зі своєю командою першу премію за проект житлового комплексу Настола-Ракоківі у Фінляндії. Після перемоги в конкурсі на проект центру відпочинку та оглядової вежі Ліннамакі в Гельсінкі, разом з Везіо Нава відкрив власну архітектурну практику "Nava Vogel Arkkitehtitoimisto". Був прийнятий до фінської спілки архітекторів SAFA та до спілки архітекторів Північних країн NRA.

У 1976 році емігрував з дружиною Барбарою Фогель та донькою до Канади. Виконував дипломні проекти в Школі архітектури Університету Торонто та працював в архітектурних бюро. З 1978 року почав співпрацювати з торонтським офісом The DuBois Pumb Partnership, партнером якого став у 1983 році. Він був співавтором проекту нового комплексу посольства Канади в Китаї (1982) та житлового комплексу Oaklands Condominium в Торонто, який був нагороджений медаллю генерал-губернатора в 1983 році. Яцек Фогель є співавтором лікарні Souris на острові Принца Едварда, медичного центру Camp Hill в Галіфаксі та багатьох інших будівель. У 1982 році він отримав стипендію RAIC для вивчення архітектури Далекого Сходу - Китаю та Японії. У Гонконзі він працював з офісом професора Тао Хо над проектом для міжнародного конкурсу на пік Вікторія.

Викладав та був запрошеним критиком на архітектурних факультетах: Торонтського університету, Університету Райерсона, Міжнародної академії дизайну в Торонто. З 1989 по 2015 рік працював професором у Школі архітектури Хамберського технологічного інституту в Торонто. У 1982 році був прийнятий до OAA (Асоціація архітекторів Онтаріо) та MRAIC (Королівський канадський інститут архітектури). З 1987 по 1990 рік очолював проектну групу в "Zeidler Roberts Architects". Основними проектами цього періоду були розширення готелю Park Plaza в Торонто, медичний центр Sunnybrook, розширення Canary Warf в Лондоні.

У 1990 році Яцек і Барбара Фоґель заснували власне архітектурне бюро "Vogel Architects Inc." для проектування громадських будівель, квартир, готелів та дизайну інтер'єрів. Всі проекти, створені в цій фірмі, є співавторами Яцека і Барбари Фоґель. Багато проектів були опубліковані в канадських і міжнародних архітектурних журналах. У 1999 році вони отримали нагороду архітектурної майстерності від Асоціації архітекторів Онтаріо за проект експериментального екологічного літнього будинку. Офіс "Vogel Architects Inc." спроектував і реалізував низку канадських посольств: у Берліні, Гаазі, Сеулі. Ці проекти були отримані в результаті архітектурних конкурсів і виконані у співпраці з іншими бюро. Важливим проектом бюро став конференц-готельний комплекс Gebel Hammam Pharaon на Синайському півострові в Єгипті. У 2007 році бюро виграло міжнародний конкурс на будівництво багатоцільового розважального та готельного центру Southlands на Бермудських островах.

У 2000 році Яцек Фогель був призначений членом Королівської канадської академії мистецтв. За свій внесок у візуальне мистецтво у 2012 році він був нагороджений ювілейною медаллю королеви Єлизавети II. Ювілейною медаллю королеви Єлизавети ІІ. Барбара та Яцек Фоґель заснували стипендію для студентів-архітекторів - Arthur Erickson Travel Award, яка присуджується Королівською канадською академією з 2015 року.